cron dziala na danych zapisanych w
/var/spool/cron/crontabs/
Nie edytuje się ich bezpośrednio, lecz wymusza załadowanie z pliku:
crontab /etc/config/crontab
Trzeba tu wspomnieć, że /etc/config/crontab jest podlinkowany do /mnt/HDA_ROOT/.config/crontab, a więc w Twoim przypadku, przed restartem...