W przypadku niektórych języków istnieje kilka sposobów wprowadzenia tego samego znaku za pomocą klawiatury. Znaki te będą wyglądały dla użytkownika identycznie, ale nie są takie same dla różnych systemów operacyjnych i Qsync. Dwa formaty, które mogą powodować konflikty, to Unicode NFC i Unicode NFD.
Gdy Qsync wykryje konflikt kodowania Unicode, doda do nazwy pliku lub folderu, którego dotyczy konflikt, frazę „(Conflicted encode (x))”.